羊肚菌多生長在闊葉林或針闊混交林的腐殖質層上。主要生長于富含腐殖質的沙壤土中或褐土、棕壤等。
羊肚菌一般在低溫、高濕條件下易萌發子實體，因此野生羊肚菌子實體的生長季節一般在每年3-5月或8-9月。
一般來說，羊肚菌多發生在土壤濕潤或降雨量多而且容易保濕或地下水位較高的環境中。光線對子實體的形成有一定的促進作用，子實體的生長發育具有趨光性。足夠的氧氣和通風良好的場所是保證羊肚菌正常生長發育的必要條件。
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